作為RNA干擾實驗的第一步,靶位點的選擇以及相應的shRNA表達載體的構建,是整個RNA干擾實驗的重中之重。靶位點選擇恰當,shRNA干擾效率高,整個RNA干擾實驗就能夠事半功倍,否則,就會做許多無用功。
目前,有許多免費軟件或網站能夠提供靶位點選擇及shRNA序列設計,但是這種免費軟件算法落后,設計出的shRNA序列有效率只有25%-30% 左右。與之相對應的是一些商業化軟件,或者現成的商業化shRNA庫,由于其算法先進、設計原則合理,其提供的shRNA序列的有效率通常能達到75%以 上,即可以達到每四條shRNA中有三條有效。所以,如果采用商業化軟件來設計shRNA,或者直接購買現成的商業化shRNA庫,將能使您在整個RNA 干擾實驗之始便占得先機。
基于以上,贏潤生物在國內率先引進代表RNA干擾領域全球頂尖水準的TRC (The RNAi, RNA干擾協會)開發的TRC shRNA庫。該庫針對人、小鼠、大鼠等數萬個基因,每個基因提供3-5 條shRNA (己構建至載體上) ,總數達五萬多條,且數量還在不斷增加。經過大規模實驗驗證,其中超過75%均為有效shRNA ,其干擾效率均大于70%.
以此shRNA庫為基礎,針對每個基因,我們可為您提供3-5條高質量的shRNA序列,并為您構建到sRNA真核表達載體上。由于此數據庫中的 shRNA序列有效性超過75% ,即理論上來說,每一套shRNA克隆中,必定至少有一條shRNA的干擾效率超過70% 。所以,您再也不必擔心選擇的shRNA序列沒有干擾效果,您再也不用費時費力費心地去一遍遍地篩選有效的shRNA序列。選用此shRNA庫,您會發 現,原來RNA干擾實驗會如此簡單!
您只需告訴我們您需要干擾的目的基因,我們就會為您從數據庫中調取相應的shRNA序列信息,然后,您可以選擇合適的shRNA達系統來表達shRNA ,進行RNA干擾實驗。
TIPS : TRC及TRC shRNA庫
TRC (The RNAi ,RNAA干擾協會)是由麻省理工學院和哈佛大學牽頭建立的合作機構,包括Massachusetts General Hospital 、Harvard Med school 、Dana Farber Cancer Inst 、The Broad Institute 、Whitehead lnstitute 、MlT、Academica Sinica (Taiwan)和另外5個國際性組織,代表著RNA干擾領域的全球最頂尖水平。該組織計劃在3年內構建數量達15000個人類基因和15000個小鼠基 因的shRNA文庫。第1版的TRC shRNA文庫包括35000 shRNA克隆(其中人類基因有5300個,小鼠基因有2200個) ,其它新構建的克隆每個季度會陸續公布。
TRC shRNA克隆套裝中的原裝進口質粒,由于不帶熒光標記,使得質粒轉染細胞后,無法確定轉染效率。針對這一不足,贏潤生物將自己的shRNA表達系統與 TRC shRNA庫相結合,為客戶提供更貼心、更靈活,且RNA干擾效率絲毫不減的shRNA表達質粒產品。也就是說, shRNA序列依然參考TRC shRNA庫中的數據,而承載這些shRNA片段的載體,則采用多種啟動子、多種熒光標記可供選擇的贏潤生物shRNA表達系統。
本公司目前提供的shRNA真核表達載體,共有hU6 、mU6 、hH1, h7SK四種pol Ⅲ型啟動子可供選擇,可選擇攜帶熒光(包括綠色熒光、紅色熒光)或不攜帶熒光。除此之外,本公司還提供mirshRNA真核表達載體,可以進行 mirshRNA真核表達載體構建。
構建的shRNA真核表達載體,既可以當作普通的shRNA表達載體使用,也可以用來包裝腺病毒、慢病毒或腺相關病毒。如果您的目的細胞質粒轉染效 率較高(建議大于70%) ,則您可以直接使用帶有目的shRNA的pYr系列質粒進行RNA干擾實驗。而如果您的目的細胞質粒轉染效率較低,則可直接以這些載體為基礎,包裝腺病 毒、慢病毒或腺相關病毒,然后再用病毒感染目的細胞。利用病毒的高感染效率、高表達效率,更好地進行RNA干擾研究實驗。
既可以當普通的shRNA真核表達載體使用,同時又可以拿來包裝腺病毒、慢病毒或腺相關病毒,花一份錢,買兩樣東西!而且其干擾有效性、干擾效率大 部分都超過70%!這么超值、這么優秀、性價比如此高的shRNA產品,您還等什么呢?趕緊撥打我們的電話,或者通過QQ 、Email聯系我們吧,您只需報上目的基因的NCBI序列號, 后面的事,我們替您完成!
贏潤生物shRNA表達載體列表
載體名稱 | 啟動子 | 熒光標記 | 真核篩選標記 | 是否可包病毒 |
---|---|---|---|---|
pYr-1.1 | hU6 | EGFP | Neo | 是 |
pYr-1.2 | mU6 | EGFP | Neo | 是 |
pYr-1.3 | h7SK | EGFP | Neo | 是 |
pYr-1.4 | hH1 | EGFP | Neo | 是 |
pYr-2.1 | hU6 | 無 | Neo | 是 |
pYr-2.2 | mU6 | 無 | Neo | 是 |
pYr-2.3 | h7SK | 無 | Neo | 是 |
pYr-2.4 | hH1 | 無 | Neo | 是 |
pYr-3.1 | hU6 | EGFP | Neo | 是 |
pYr-mir30-shRNA | CMV | EGFP | Neo | 是 |
pYr-LVX-shRNA1 | hU6 | 無 | Puro | 是 |
pYr-LVX-shRNA2 | hU6 | ZsGreen1 | 無 | 是 |
pYr-LVX-shRNA3 | hU6 | EGFP | Puro | 是 |
pYr-AAV-shRNA1 | hU6 | ZsGreen1 | 無 | 是 |
pYr-AAV-shRNA2 | hU6 | tdTomato | 無 | 是 |
選用贏潤生物shRNA表達系統,具有如下優點:
shRNA序列數據來自國外成熟shRNA數據庫,質量有保證。RNA干擾效率的高低主要取決于靶位點的選擇和shRNA序列的設計,由于本公司所采用的shRNA序列來自國外成熟shRNA數據庫,算法先進,靶位點成功率高,所以shRNA的干擾成功率非常高;
您可以選擇構建一條或者多條,靈活性高;
多種啟動子,有熒光或無熒光,綠色熒光或紅色熒光等可自由選擇,以更好地配合后續實驗;
載體可作為普通shRNA表達載體使用,亦可作為病毒包裝系統的穿梭載體或表達載體使用,以進行腺病毒、慢病毒或腺相關病毒包裝。
服務項目 | 服務價格(元) | 服務周期 |
---|---|---|
shRNA 表達載體構建 | 1500/條 | 2-3周 |
NC 對照 | 500(三條以上免費贈送) | 現貨 |
轉染級質粒大提( 100ug ) | 400/個 | 1周 |
測序 | 免費 | 1周 |
請事先確定是否需要熒光;
您可以訂購贏潤生物shRNA克隆套裝(己裝載至載體的三條shRNA 、NC對照質粒) ,僅需4000元;
由于小提質粒在轉染細胞時,無論是濃度、純度還是內毒素含量均不是很合格,所以本公司建議您訂購一個"轉染級質粒大提"服務,400元/個,至少 提供轉染級大提質粒100ug.如果您訂購贏潤生物shRNA克隆套裝,且將套裝中的4個質粒均做大提,則大提費用可優惠至250元/個。
本公司承諾,如客戶訂購針對某個基因的贏潤生物shRNA克隆套裝(3-5條shRNA), 則本公司保證其中至少有一條shRNA是有效的,其干擾效率大于70% 。在目的細胞轉染效率大于80% ,且客戶檢測shRNA有效性的實驗方法恰當、操作正確的前提下,如果沒有達到上述標準,本公司將免費為客戶重新設計和構建兩條shRNA 。如果五條shRNA都無效,則本公司將全額退還客戶己付款項;
如果shRNA序列由客戶自己設計,本公司只負責成功構建shRNA表達載體,對其中shRNA的干擾有效性不做任何保證;
如果客戶訂購的shRNA條數在三條以下,本公司不保證設計的shRNA一定有效;
如果客戶需委托本公司完成shRNA的有效性驗證實驗,則需加收驗證部分的實驗費用
注:本站商品信息均來自于廠商,其真實性、準確性和合法性由信息擁有者(廠商)負責。本站不提供任何保證,并不承擔任何法律責任。
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